MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011731	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011731	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011731	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011731	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011731	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011731	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011731	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011731	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011731	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011731	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011731	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011731	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011731	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011731	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011731	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011731	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011731	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011731	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011731	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011731	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011731	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011731	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011731	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011731	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011731	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011731	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011731	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011731	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011731	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011731	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011731	G	6	6	7819	7824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011731	AAT	2	6	12437	12442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011731	TAA	2	6	12457	12462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011731	TTG	2	6	12474	12479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011731	TGA	2	6	12487	12492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011731	CTC	2	6	12548	12553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011731	GGACT	2	10	12559	12568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011731	A	6	6	12615	12620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011731	AACTT	2	10	12644	12653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011731	TAA	2	6	12659	12664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011731	ACT	2	6	12673	12678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011731	ACA	2	6	12686	12691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011731	CA	3	6	12695	12700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011731	T	8	8	12706	12713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011731	TGA	2	6	12851	12856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011731	ATT	2	6	12879	12884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011731	TCT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011731	GAA	3	9	12906	12914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011731	TAAT	2	8	12916	12923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011731	T	7	7	12936	12942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011731	GCT	2	6	12972	12977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011731	GAA	2	6	12981	12986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011731	TTC	2	6	12992	12997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011731	AT	3	6	13092	13097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011731	CTA	2	6	13135	13140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011731	AAC	2	6	13187	13192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011731	TACTT	2	10	13202	13211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011731	AAAGT	2	10	13302	13311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011731	ATT	2	6	13380	13385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011731	T	6	6	13431	13436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011731	AGACAC	2	12	13493	13504	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011731	A	8	8	13539	13546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011731	ATTACT	2	12	13554	13565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011731	GAT	2	6	13566	13571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011731	TAC	2	6	13589	13594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011731	AGAT	2	8	13595	13602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011731	TATTGA	2	12	13607	13618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011731	ACAGAA	2	12	13682	13693	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011731	AT	3	6	13777	13782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011731	TATC	2	8	13806	13813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011731	TGA	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011731	TAC	2	6	13949	13954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011731	TAA	2	6	13993	13998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011731	AAAC	2	8	13999	14006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011731	TAC	2	6	14009	14014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011731	A	6	6	14034	14039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011731	A	6	6	14051	14056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011731	AGAAA	2	10	14069	14078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011731	A	6	6	14097	14102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011731	TTA	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011731	ATT	2	6	14166	14171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011731	TAA	2	6	14195	14200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011731	AAC	2	6	14229	14234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011731	TA	3	6	15087	15092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011731	TAAAAA	2	12	15102	15113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011731	ATA	2	6	16439	16444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011731	CTA	2	6	17095	17100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011731	ATA	2	6	17126	17131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011731	TAA	2	6	17155	17160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011731	TAA	3	9	17177	17185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011731	A	7	7	17184	17190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011731	ATAAAA	2	12	17850	17861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011731	ATT	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011731	AGC	2	6	17882	17887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011731	TAA	2	6	18882	18887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011731	TA	3	6	18893	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011731	CTT	2	6	18919	18924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011731	A	6	6	18939	18944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011731	TAT	3	9	18999	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011731	ATA	2	6	19045	19050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011731	TTAAA	2	10	19088	19097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011731	T	7	7	19126	19132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011731	TAA	2	6	19151	19156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011731	T	7	7	19170	19176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011731	TACT	2	8	19217	19224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011731	T	7	7	21670	21676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011731	T	6	6	22978	22983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011731	TAT	2	6	22993	22998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011731	TAAA	2	8	23022	23029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011731	AATA	2	8	23056	23063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011731	TAAGC	2	10	23128	23137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011731	TTA	2	6	23146	23151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011731	TAA	2	6	23172	23177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011731	TATT	2	8	23184	23191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011731	ATA	2	6	23192	23197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011731	ATATGT	2	12	23238	23249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011731	A	7	7	23256	23262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011731	A	7	7	23275	23281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011731	T	7	7	23341	23347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011731	AAG	2	6	23362	23367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011731	TA	3	6	23388	23393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011731	TTAT	2	8	23395	23402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011731	A	6	6	24764	24769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011731	A	7	7	24772	24778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011731	AGG	2	6	24791	24796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011731	ATTA	2	8	24797	24804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011731	ATTA	2	8	26065	26072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011731	CAAAAA	2	12	26094	26105	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011731	TG	3	6	26121	26126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011731	AAGA	2	8	26202	26209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011731	TA	3	6	26211	26216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011731	AT	3	6	26226	26231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011731	AATTT	2	10	26246	26255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011731	GA	3	6	26301	26306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011731	T	6	6	26307	26312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011731	TA	3	6	26373	26378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011731	ATT	2	6	26401	26406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011731	A	8	8	27509	27516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011731	A	7	7	27534	27540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011731	TAT	2	6	27541	27546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011731	T	7	7	27553	27559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011731	ATAAA	2	10	27561	27570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011731	A	6	6	27593	27598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011731	AATA	2	8	28294	28301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011731	TAA	2	6	28324	28329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011731	ATA	2	6	28331	28336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011731	CAAA	2	8	28990	28997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011731	ACA	2	6	29005	29010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011731	AAAT	2	8	29028	29035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011731	TTC	2	6	29073	29078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011731	AATT	2	8	29079	29086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011731	GAA	2	6	29098	29103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011731	A	7	7	29123	29129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011731	AAT	2	6	29152	29157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011731	A	7	7	29159	29165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011731	GCG	2	6	29177	29182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011731	TAGC	2	8	29186	29193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011731	AAT	2	6	29269	29274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011731	TAT	2	6	29277	29282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011731	CTT	2	6	29344	29349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011731	AT	3	6	29385	29390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011731	TGAT	2	8	29393	29400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011731	TGG	2	6	29421	29426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011731	AGG	2	6	29519	29524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011731	TAT	2	6	29556	29561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011731	ATC	2	6	29579	29584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011731	ATA	2	6	29615	29620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011731	CAT	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_011731	AGCA	2	8	29754	29761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_011731	AAAT	2	8	29780	29787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011731	TGA	2	6	29793	29798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011731	GGA	2	6	29848	29853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011731	TGA	2	6	29886	29891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011731	TAT	2	6	29896	29901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011731	TAT	2	6	29943	29948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011731	ATA	2	6	30011	30016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011731	TGG	2	6	30027	30032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011731	ATA	2	6	30062	30067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011731	TAA	2	6	30108	30113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011731	AAC	2	6	30126	30131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_011731	TTACA	2	10	30162	30171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_011731	AGT	2	6	30178	30183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011731	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_011731	ATG	3	9	30233	30241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011731	GCA	2	6	30259	30264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_011731	TGT	2	6	30272	30277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_011731	AG	3	6	30289	30294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.